{"id":8987,"date":"2021-05-28T07:37:09","date_gmt":"2021-05-28T07:37:09","guid":{"rendered":"https:\/\/www.sardinasystems.com\/news-news-de\/fishos-fallstudie-openstack-und-ceph-basierte-cloud-bei-der-de-nbi\/"},"modified":"2025-05-14T16:36:43","modified_gmt":"2025-05-14T16:36:43","slug":"fishos-use-case-openstack-and-ceph-based-cloud-at-the-de-nbi","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/www.sardinasystems.com\/de\/blog\/fishos-use-case-openstack-and-ceph-based-cloud-at-the-de-nbi\/","title":{"rendered":"FishOS Fallstudie: OpenStack und Ceph basierte Cloud bei der de.NBI"},"content":{"rendered":"\n<h2 class=\"wp-block-heading\">FishOS betreibt die Cloud der Eberhard-Karls-Universit\u00e4t, die \u00fcber das Universit\u00e4tsrechenzentrum in T\u00fcbingen eine Cloud-Umgebung f\u00fcr Bioinformatiker bereitstellt.  <\/h2>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Das <a href=\"https:\/\/www.denbi.de\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Deutsche Netzwerk f\u00fcr Bioinformatik-Infrastruktur<\/a>, kurz &#8222;de.NBI&#8220;, ist eine nationale Forschungsinfrastruktur, die Bioinformatik-Dienste f\u00fcr Nutzer aus der lebenswissenschaftlichen Forschung, der Biomedizin und verwandten Bereichen bereitstellt. Durch ein Cloud-F\u00f6derationskonzept sind alle f\u00fcnf de.NBI-Standorte, Uni Bielefeld, Uni Freiburg, Uni T\u00fcbingen, Uni Heidelberg und Uni Gie\u00dfen, in eine einzige Cloud-Plattform integriert. Im Ergebnis wird der Nutzer \u00fcber das zentrale de.NBI-Cloud-Portal zu dem gew\u00fcnschten Dienst und der passenden Cloud gef\u00fchrt. <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\"><a href=\"https:\/\/www.sardinasystems.com\/de\/fishos\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Sardina FishOS<\/a> bildet das R\u00fcckgrat der de.NBI Cloud, um fortschrittliche wissenschaftliche Entdeckungen in Europa zu erm\u00f6glichen. Die hochzuverl\u00e4ssige, auf <a href=\"https:\/\/www.sardinasystems.com\/de\/fishos\/openstack\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">OpenStack<\/a> und <a href=\"https:\/\/www.sardinasystems.com\/de\/fishos\/ceph-speicher\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Ceph<\/a> basierende Plattform erm\u00f6glicht integrative Analysen und eine effiziente Nutzung von Daten, um wissenschaftliche Durchbr\u00fcche zu erzielen.  <\/p>\n\n<p class=\"has-medium-font-size wp-block-paragraph\"><strong>Das Ziel<\/strong><\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Die verschiedenen Systeme von de.NBI kombinieren FishOS OpenStack und Ceph, um hochzuverl\u00e4ssige Plattformen f\u00fcr traditionelle Forschung und Next-Gen-Anwendungen mit Datensicherheit und -schutz zu bieten.  <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Um die Ziele von de.NBI zu erreichen, geh\u00f6rten zu den kritischen Anforderungen an den Ceph-Speicher: Geo-Redundanz \u00fcber mehrere Standorte, Verschl\u00fcsselung im Ruhezustand, asynchrone Spiegelung, Wahl zwischen uni- oder bidirektionaler Spiegelung. Die Systeme unterst\u00fctzen mehrere Speicherkonfigurationen und Konfigurationen pro Pool, sowohl f\u00fcr den Snapshot- als auch f\u00fcr den Journal-Modus der Spiegelung, und f\u00fcr Snapshots, die so eingestellt sind, dass sie zu geplanten Zeiten erstellt werden.  <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Um die Berechnungen zu beschleunigen, verf\u00fcgt die Cloud-Plattform \u00fcber eine fortschrittliche Nvidia GPU-Beschleunigung.  <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Mit mehreren OpenStack- und Ceph-basierten Clouds, die sich \u00fcber mehrere Standorte und Regionen erstrecken, wird der t\u00e4gliche Betrieb der Systeme durch vorintegrierte Betriebstools f\u00fcr die Cloud-Plattform mit intelligenten pr\u00e4diktiven Analysen und intelligentem Ressourcenmanagement einfach und flexibel gestaltet.  <\/p>\n\n<p class=\"has-medium-font-size wp-block-paragraph\"><strong>FishOS-L\u00f6sung  <\/strong><\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Sardina implementierte ein L\u00f6sungskonzept, das auf der Betriebsarchitektur von FishOS basiert und es de.NBI erm\u00f6glicht, die verschiedenen Systeme mit vollautomatischen, flexiblen, zuverl\u00e4ssigen und skalierbaren Abl\u00e4ufen zu verwalten und ein marktweit einzigartiges Zero-Downtime-Upgrade durchzuf\u00fchren. Heute betreibt de.NBI vier Systeme mit einer FishOS-L\u00f6sung, die auf OpenStack, <a href=\"https:\/\/www.sardinasystems.com\/de\/fishos\/kubernetes\/\" target=\"_blank\" rel=\"noreferrer noopener\">Kubernetes<\/a> und Ceph basiert. Sardina hat auch eines der Systeme von Ubuntu OpenStack migriert.  <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Die FishOS-L\u00f6sungsarchitektur ist flexibel, um die Datenspeicherung zu skalieren, elastische Rechendienstressourcen bereitzustellen, ein automatisiertes Ressourcenmanagement zu erm\u00f6glichen, die Vernetzung zu vereinfachen und die Verf\u00fcgbarkeit der Datenanalyse zu gew\u00e4hrleisten.  <\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Die automatisierte Self-Service-Cloud-Technologie von FishOS erm\u00f6glicht standardm\u00e4\u00dfig Hochverf\u00fcgbarkeit, intelligente Selbstheilungsprozesse, nahtlose Rolling Upgrades, Skalierung auf Tausende von Servern, bessere Auslastung, mehr Sicherheit und geringere Kosten. Die de.NBI Cloud powered by FishOS erm\u00f6glicht integrative Analysen f\u00fcr die europ\u00e4ische Life-Science-Community und die effiziente Nutzung von Daten in Forschung und Anwendung bei optimierten TCO.<\/p>\n\n<p class=\"has-medium-font-size wp-block-paragraph\"><strong>Die Vorteile  <\/strong><\/p>\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>Automatisierte Null-Klick-Vorg\u00e4nge<\/li>\n\n\n\n<li>Optimierte TCO: 10x niedrigere OpEx&amp;CapEx<\/li>\n\n\n\n<li>Sicherheit und Schutz von Daten<\/li>\n\n\n\n<li>Erh\u00f6hte Widerstandsf\u00e4higkeit und Flexibilit\u00e4t<\/li>\n\n\n\n<li>Elastische Verg\u00fctung bei wachsender Wirtschaft<\/li>\n\n\n\n<li>Einfacher Aufbau gro\u00dfer Systeme, die sich auf mehrere Standorte erstrecken<\/li>\n<\/ul>\n\n<p class=\"has-medium-font-size wp-block-paragraph\"><strong>de.NBI Cloud: Eberhard Karls Universit\u00e4t T\u00fcbingen<\/strong> <strong>&#8211; <\/strong>Eine f\u00f6derierte und georedundante L\u00f6sung f\u00fcr gro\u00dfe wissenschaftliche Daten<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">FishOS betreibt die Cloud an der Eberhard Karls Universit\u00e4t T\u00fcbingen. FishOS bietet eine Cloud-Umgebung f\u00fcr Bioinformatiker \u00fcber das Universit\u00e4tsrechenzentrum in T\u00fcbingen. Dazu geh\u00f6ren zum einen die Infrastruktur, verschiedene Workflow-L\u00f6sungen zum Aufbau von Pipelines und Tools mit besonderem Schwerpunkt auf der Analyse von Hochdurchsatzdaten (Genomik, Proteomik, Metabolomik usw.).<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Zweitens ist ein Hauptziel des de.NBI-Cloud-Standortes in T\u00fcbingen die Bereitstellung von Software, die verschiedene wissenschaftliche Forschungsbereiche wie Massenspektrometrie-Analysen, NGS-Analyse-Pipelines, aber auch molekulares Docking \u00fcber den in Galaxy-Workflows integrierten Ball (Galaxy) abdeckt.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">FishOS erleichtert den allt\u00e4glichen Betrieb der Systeme der Universit\u00e4t T\u00fcbingen und macht ihn dank der vorintegrierten Betriebswerkzeuge f\u00fcr die Cloud-Plattform einfach und flexibel. Die Nutzer der Systeme profitieren von intelligenten pr\u00e4diktiven Analysen und intelligentem Ressourcenmanagement.<\/p>\n\n<p class=\"has-medium-font-size wp-block-paragraph\"><strong>de.NBI cloud: Justus-Liebig-Universit\u00e4t (JLU) Gie\u00dfen<\/strong><\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">FishOS betreibt die de.NBI-Cloud-Infrastruktur an der Justus-Liebig-Universit\u00e4t (JLU) Gie\u00dfen. Dieses wurde Anfang 2017 erfolgreich eingerichtet und stellt den Nutzern des de.NBI-Netzes umfangreiche Rechen- und Speicherressourcen zur Verf\u00fcgung. Eine Erweiterung der gesamten Speicherkapazit\u00e4t ist bereits im Gange und wird in der ersten Jahresh\u00e4lfte 2018 verf\u00fcgbar sein.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Nach der Ersteinrichtung und intensiven Tests wurde die Cloud an der JLU Gie\u00dfen im Juni 2017 in den Produktionsbetrieb \u00fcberf\u00fchrt. Es wurde bereits erfolgreich f\u00fcr die Durchf\u00fchrung praktischer Sitzungen w\u00e4hrend der ersten de.NBI-Sommerschule zum Thema Cloud Computing f\u00fcr die Bioinformatik eingesetzt.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Bei dieser Gelegenheit wandten 24 Teilnehmer Cloud-Computing-Techniken f\u00fcr die Analyse ihrer eigenen biologischen Datens\u00e4tze an. Sie lernten, wie man skalierbare Bioinformatik-Softwarel\u00f6sungen in einer Cloud-Umgebung implementiert. Seit ihrer Einrichtung wird die Cloud regelm\u00e4\u00dfig von verschiedenen Kooperationspartnern und Nutzern des de.NBI-Netzwerks zur Analyse ihrer Daten genutzt.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\">Die Rechenressourcen f\u00fcr die Ausf\u00fchrung virtueller Maschinen werden durch eine Auswahl verschiedener Speicherl\u00f6sungen erg\u00e4nzt, darunter SSD-basierte ephemere Festplatten, Datenvolumina und Objektspeicher, die zur Speicherung von Roh- und Zwischendaten sowie der Endergebnisse bioinformatischer Analysepipelines verwendet werden k\u00f6nnen.<\/p>\n\n<p class=\"wp-block-paragraph\"><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>FishOS betreibt die Cloud der Eberhard-Karls-Universit\u00e4t, die \u00fcber das Universit\u00e4tsrechenzentrum in T\u00fcbingen eine Cloud-Umgebung f\u00fcr Bioinformatiker bereitstellt. 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