FishOS alimenta la nube de la Universidad Eberhard Karls, proporcionando un entorno en la nube para bioinformáticos a través del centro informático de la universidad en Tubinga.
La Red Alemana de Infraestructuras Bioinformáticas, o abreviadamente «de.NBI», es una infraestructura nacional de investigación que presta servicios bioinformáticos a usuarios de la investigación en ciencias de la vida, biomedicina y campos afines. Mediante un concepto de federación en la nube, las cinco sedes de de.NBI, Bielefeld Uni, Freiburg Uni, Tübingen Uni, Heidelberg Uni y Giessen Uni, están integradas en una única plataforma en la nube. Como resultado, el usuario será guiado al servicio previsto y a la nube adecuada a través del portal central de la nube de.NBI.
Sardina FishOS forma la columna vertebral de de.NBI Cloud, para facilitar los descubrimientos científicos europeos avanzados. La plataforma altamente fiable basada en OpenStack y Ceph permite realizar análisis integradores y un uso eficiente de los datos para lograr avances científicos.
El objetivo
Los múltiples sistemas de.NBI combinan FishOS OpenStack y Ceph para proporcionar plataformas ultrafiables para la investigación tradicional y las aplicaciones de nueva generación, con seguridad y protección de datos.
Para lograr los objetivos de de.NBI, los requisitos fundamentales del almacenamiento Ceph eran: georredundancia en varios sitios, cifrado en reposo, duplicación asíncrona y elección de duplicación unidireccional o bidireccional. Los sistemas admiten múltiples configuraciones de almacenamiento y por pool, para los modos de réplica instantánea y de diario, y para las instantáneas configuradas para tomarlas a horas programadas.
Para acelerar los cálculos, la plataforma en la nube incorpora aceleración avanzada de GPU Nvidia.
Con múltiples nubes basadas en OpenStack y Ceph que abarcan múltiples ubicaciones y regiones, el funcionamiento diario de los sistemas se hace sencillo y flexible, con herramientas de operaciones preintegradas para la plataforma en nube, con análisis predictivos inteligentes y gestión inteligente de recursos.
Solución FishOS
Sardina implementó un diseño de solución, basado en la arquitectura operativa de FishOS, que permite a de.NBI gestionar los múltiples sistemas con operaciones totalmente automatizadas, flexibles, fiables y escalables, y una actualización Zero-Downtime única en el mercado. En la actualidad, de.NBI gestiona cuatro sistemas con una solución FishOS basada en OpenStack, Kubernetes y Ceph. Sardina también migró uno de los sistemas desde Ubuntu OpenStack.
La arquitectura de la solución FishOS es flexible para escalar el almacenamiento de datos, proporcionar recursos elásticos de servicio informático, ofrecer una gestión automatizada de los recursos, facilitar la conexión en red y garantizar la disponibilidad del análisis de datos.
La tecnología de nube automatizada de autoservicio FishOS permite una alta disponibilidad por defecto, ofrece operaciones inteligentes de autorreparación, actualizaciones continuas sin interrupciones, escalado a miles de servidores, mejora la utilización, aborda la seguridad y reduce los costes. La nube de.NBI impulsada por FishOS permite análisis integradores para la comunidad europea de ciencias de la vida y el uso eficiente de los datos en investigación y aplicaciones, con un coste total de propiedad optimizado.
Los beneficios
- Operaciones automatizadas sin clic
- TCO optimizado: 10 veces menos OpEx&CapEx
- Seguridad y protección de datos
- Mayor resistencia y flexibilidad
- Economía elástica a medida que creces
- Construye fácilmente sistemas a gran escala que se extiendan a múltiples sedes
de.NBI Cloud: Universidad Eberhard Karls de Tubinga – Una solución federada y georedundante para grandes datos científicos
FishOS impulsa la nube en la Universidad Eberhard Karls de Tubinga. FishOS proporciona un entorno en la nube para bioinformáticos a través del centro informático universitario de Tubinga. En primer lugar, incluye infraestructura, varias soluciones de flujo de trabajo para construir pipelines, y herramientas con un enfoque particular en el análisis de datos de alto rendimiento (genómica, proteómica, metabolómica, etc.).
En segundo lugar, uno de los principales objetivos del sitio en la nube de.NBI en Tubinga es proporcionar software que cubra distintos campos científicos de la investigación, como el análisis por espectrometría de masas, las tuberías de análisis NGS, pero también el acoplamiento molecular mediante Ball integrado en los flujos de trabajo de Galaxy (galaxia).
FishOS facilita el funcionamiento diario de los sistemas de la Universidad de Tubinga haciéndolo sencillo y flexible gracias a sus herramientas de operaciones preintegradas para la plataforma en la nube. Los usuarios de los sistemas se benefician de un análisis predictivo inteligente y de una gestión inteligente de los recursos.
de.NBI cloud: Universidad Justus-Liebig (JLU) de Giessen
FishOS impulsa la infraestructura en la nube de.NBI en la Universidad Justus-Liebig (JLU) de Giessen. Se estableció con éxito a principios de 2017, proporcionando recursos informáticos y de almacenamiento a gran escala a los usuarios de la red de.NBI. Ya está en marcha una ampliación de la capacidad global de almacenamiento, que estará disponible en el primer semestre de 2018.
Tras la configuración inicial y las pruebas intensivas, la nube de JLU Giessen se transfirió al modo de producción en junio de 2017. Ya se ha utilizado con éxito para llevar a cabo sesiones prácticas durante la primera escuela de verano de.NBI sobre computación en nube para bioinformática.
En esta ocasión, 24 participantes aplicaron técnicas de computación en nube para el análisis de sus propios conjuntos de datos biológicos. Aprendieron a implementar soluciones de software bioinformático escalables en un entorno de nube. Desde su creación, la nube es utilizada regularmente por varios socios colaboradores y usuarios de la red de.NBI para analizar sus datos.
Los recursos informáticos para ejecutar máquinas virtuales se complementan con una selección de diversas soluciones de almacenamiento, como discos efímeros basados en SSD, volúmenes de datos y almacenamiento de objetos, que pueden utilizarse para almacenar datos brutos e intermedios, así como los resultados finales de los conductos de análisis bioinformático.