FishOS mendukung cloud Universitas Eberhard Karls, menyediakan lingkungan cloud untuk para ahli bioinformatika melalui pusat komputasi universitas di Tübingen.
German Network for Bioinformatics Infrastructure, atau singkatnya “de.NBI”, adalah sebuah infrastruktur penelitian nasional yang menyediakan layanan bioinformatika untuk pengguna dalam penelitian ilmu hayati, biomedis, dan bidang-bidang terkait. Melalui konsep federasi cloud, kelima situs de.NBI, yaitu Bielefeld Uni, Freiburg Uni, Tübingen Uni, Heidelberg Uni, dan Giessen Uni, diintegrasikan ke dalam satu platform cloud. Sebagai hasilnya, pengguna akan dipandu ke layanan yang diinginkan dan cloud yang sesuai melalui portal cloud de.NBI pusat.
Sardina FishOS menjadi tulang punggung de.NBI Cloud, untuk memfasilitasi penemuan ilmiah tingkat lanjut di Eropa. Platform yang sangat andal berbasis OpenStack dan Ceph memungkinkan analisis integratif dan penggunaan data yang efisien menuju terobosan ilmiah.
Tujuannya
Berbagai sistem de.NBI menggabungkan FishOS OpenStack dan Ceph untuk menyediakan platform yang sangat andal untuk penelitian tradisional dan aplikasi generasi berikutnya, dengan keamanan dan perlindungan data.
Untuk mencapai tujuan de.NBI, persyaratan penting untuk penyimpanan Ceph meliputi: geo-redundansi di beberapa lokasi, enkripsi-at-rest, pencerminan asinkron, pilihan pencerminan satu arah atau dua arah. Sistem ini mendukung beberapa penyimpanan dan konfigurasi per-pool, baik untuk mode snapshot maupun jurnal mirroring, dan untuk snapshot yang diatur untuk diambil pada waktu yang dijadwalkan.
Untuk mempercepat komputasi, platform cloud memiliki fitur akselerasi GPU Nvidia yang canggih.
Dengan beberapa cloud berbasis OpenStack dan Ceph yang menjangkau berbagai lokasi dan wilayah, pengoperasian sistem sehari-hari menjadi sederhana dan fleksibel, dengan alat bantu pengoperasian yang sudah terintegrasi untuk platform cloud, dengan analitik prediktif yang cerdas dan manajemen sumber daya yang cerdas.
Solusi FishOS
Sardina menerapkan desain solusi, berdasarkan arsitektur operasional FishOS, yang memungkinkan de.NBI untuk mengelola beberapa sistem dengan operasi yang sepenuhnya otomatis, fleksibel, andal, dan dapat diskalakan, serta peningkatan Zero-Downtime yang unik di pasar. Saat ini, de.NBI menjalankan empat sistem dengan solusi FishOS yang berbasiskan OpenStack, Kubernetes, dan Ceph. Sardina juga melakukan migrasi salah satu sistem dari Ubuntu OpenStack.
Arsitektur solusi FishOS fleksibel untuk meningkatkan penyimpanan data, menyediakan sumber daya layanan komputasi yang elastis, memberikan manajemen sumber daya otomatis, memudahkan jaringan, dan menjamin ketersediaan analisis data.
Teknologi cloud otomatis layanan mandiri FishOS memungkinkan ketersediaan tinggi secara default, memberikan operasi penyembuhan mandiri yang cerdas, peningkatan bergulir tanpa batas, penskalaan ke ribuan server, meningkatkan pemanfaatan, mengatasi keamanan, dan menurunkan biaya. Cloud de.NBI yang didukung oleh FishOS memungkinkan analisis integratif untuk komunitas ilmu hayati Eropa dan penggunaan data yang efisien dalam penelitian dan aplikasi, dengan TCO yang dioptimalkan.
Manfaatnya
- Operasi klik nol otomatis
- TCO yang dioptimalkan: OpEx & CapEx 10x lebih rendah
- Keamanan dan perlindungan data
- Peningkatan ketahanan dan fleksibilitas
- Bayaran elastis seiring dengan pertumbuhan ekonomi Anda
- Membangun sistem skala besar dengan mudah yang dapat diperluas ke beberapa lokasi
de.NBI Cloud: Eberhard Karls University of Tübingen – Solusi federasi dan georedundant untuk data ilmiah yang besar
FishOS mendukung cloud di Universitas Eberhard Karls Tübingen. FishOS menyediakan lingkungan cloud untuk para ahli bioinformatika melalui pusat komputasi universitas di Tübingen. Pertama, ini mencakup infrastruktur, berbagai solusi alur kerja untuk membangun pipeline, dan alat dengan fokus khusus pada analisis data throughput tinggi (genomik, proteomik, metabolomik, dll.).
Kedua, salah satu tujuan utama dari situs cloud de.NBI di Tübingen adalah untuk menyediakan perangkat lunak, yang mencakup berbagai bidang penelitian ilmiah seperti analisis spektrometri massa, jalur analisis NGS dan juga docking molekuler melalui Ball yang diintegrasikan ke dalam alur kerja Galaxy (galaksi).
FishOS memudahkan pengoperasian sehari-hari sistem Universitas Tubingen sehingga menjadi sederhana dan fleksibel berkat alat operasi yang sudah terintegrasi untuk platform cloud. Pengguna sistem mendapatkan manfaat dari analisis prediktif yang cerdas dan manajemen sumber daya yang cerdas.
de.NBI cloud: Universitas Justus-Liebig (JLU) Giessen
FishOS mendukung infrastruktur cloud de.NBI di Justus-Liebig-University (JLU) Giessen. Ini berhasil didirikan pada awal tahun 2017, menyediakan sumber daya komputasi dan penyimpanan berskala besar untuk pengguna jaringan de.NBI. Perluasan kapasitas penyimpanan secara keseluruhan sedang berlangsung dan akan tersedia pada paruh pertama tahun 2018.
Setelah penyiapan awal dan pengujian intensif, cloud di JLU Giessen dipindahkan ke mode produksi pada bulan Juni 2017. Ini telah berhasil digunakan untuk mengadakan sesi praktik selama sekolah musim panas pertama de.NBI tentang komputasi awan untuk bioinformatika.
Pada kesempatan ini, 24 peserta menerapkan teknik komputasi awan untuk menganalisis set data biologis mereka sendiri. Mereka belajar bagaimana mengimplementasikan solusi perangkat lunak bioinformatika yang dapat diskalakan dalam lingkungan cloud. Sejak didirikan, cloud ini secara teratur digunakan oleh berbagai mitra kerja sama dan pengguna jaringan de.NBI untuk menganalisis data mereka.
Sumber daya komputasi untuk menjalankan mesin virtual dilengkapi dengan berbagai pilihan solusi penyimpanan, termasuk disk fana berbasis SSD, volume data, dan penyimpanan objek, yang dapat digunakan untuk menyimpan data mentah dan data perantara serta hasil akhir pipeline analisis bioinformatika.