FishOS поддерживает облако Университета Эберхарда Карла, предоставляя облачную среду для биоинформатиков через вычислительный центр университета в Тюбингене.
Немецкая сеть биоинформатической инфраструктуры, или сокращённо de.NBI, — это национальная исследовательская инфраструктура, предоставляющая биоинформатические услуги пользователям в области наук о жизни, биомедицине и смежных направлениях. Концепция облачной федерации объединяет все пять площадок de.NBI — Университеты Билефельда, Фрайбурга, Тюбингена, Гейдельберга и Гиссена — в единую облачную платформу. Пользователи получают доступ к нужным сервисам и подходящему облаку через центральный облачный портал de.NBI.
FishOS от Sardina Systems является основой облака de.NBI, что способствует передовым научным открытиям в Европе. Высоконадежная платформа на базе OpenStack и Ceph обеспечивает интегративный анализ данных и их эффективное использование для научных прорывов.
Цель
Системы de.NBI объединяют FishOS OpenStack и Ceph, чтобы предоставить ультранадежные платформы для традиционных исследований и современных приложений, обеспечивая безопасность и защиту данных.
Для достижения целей de.NBI критически важными требованиями для хранения в Ceph стали: георезервирование на нескольких площадках, шифрование данных в состоянии покоя, асинхронное зеркалирование, выбор одностороннего или двустороннего зеркалирования. Системы поддерживают несколько вариантов конфигурации хранения и пер-пул конфигураций, как для режимов снимков, так и для режимов журналирования, с возможностью создания снимков по расписанию.
Для ускорения вычислений облачная платформа использует передовое ускорение Nvidia GPU.
С множеством облаков на базе OpenStack и Ceph, охватывающих различные локации и регионы, повседневная работа систем упрощается и становится гибкой благодаря предустановленным инструментам для облачной платформы, интеллектуальной аналитике и умному управлению ресурсами.
Решение FishOS
Эксперты Sardina Systems разработали решение на основе архитектуры операционной системы FishOS, которое позволяет de.NBI управлять несколькими системами с полностью автоматизированными, гибкими, надежными и масштабируемыми операциями, а также с уникальным на рынке обновлением без простоя. Сегодня de.NBI работает с четырьмя системами, использующими решение FishOS на базе OpenStack, Kubernetes и Ceph. Sardina Systems также мигрировала одну из систем с Ubuntu OpenStack.
Архитектура решения FishOS гибка для масштабирования хранения данных, предоставления эластичных вычислительных ресурсов, автоматизированного управления ресурсами, упрощения сетевого взаимодействия и гарантирует доступность аналитики данных.
Технология облака с автоматическим самообслуживанием FishOS обеспечивает высокую доступность по умолчанию, предоставляет интеллектуальное самовосстановление операций, бесшовные обновления, масштабирование до тысяч серверов, улучшает использование ресурсов, решает проблемы безопасности и снижает затраты. Облако de.NBI на базе FishOS позволяет проводить интегративные анализы для европейского сообщества в области биологических наук и эффективно использовать данные в исследованиях и приложениях, обеспечивая оптимизированную общую стоимость владения.
Преимущества
- Автоматизированные операции без кликов
- Оптимизированная общая стоимость владения (TCO): на 10x меньше эксплуатационных и капитальных затрат
- Безопасность и защита данных
- Повышенная устойчивость и гибкость
- Эластичная оплата по мере роста экономики
- Легкость в создании масштабных систем с расширением на несколько площадок
de.NBI Cloud: Университет Эберхарда Карлса в Тюбингене – Федеративное и геораспределенное решение для крупных научных данных
FishOS обеспечивает облако в Университете Эберхарда Карлса в Тюбингене. FishOS предоставляет облачную среду для биоинформатиков через вычислительный центр университета в Тюбингене. Во-первых, это включает в себя инфраструктуру, различные решения для рабочих процессов для построения конвейеров и инструменты с особым акцентом на анализ данных с высокой пропускной способностью (геномика, протеомика, метаболомика и т. д.).
Во-вторых, одной из главных целей облачного сайта de.NBI в Тюбингене является предоставление программного обеспечения, охватывающего различные научные области исследования, такие как анализ масс-спектрометрии, конвейеры анализа NGS, а также молекулярное докинг через Ball, интегрированное в рабочие процессы Galaxy (galaxy).
FishOS упрощает повседневную работу систем Университета Тюбингена, делая её простой и гибкой благодаря предварительно интегрированным инструментам для облачной платформы. Пользователи систем получают выгоду от умной предсказательной аналитики и интеллектуального управления ресурсами.
de.NBI Cloud: Университет Юстуса-Либиха (JLU) в Гисене
FishOS обеспечивает облачную инфраструктуру de.NBI в Университете Юстуса-Либиха (JLU) в Гисене. Инфраструктура была успешно создана в начале 2017 года, предоставляя ресурсы вычислений и хранения данных пользователям сети de.NBI. Расширение общей ёмкости хранения уже находится в процессе и будет доступно в первой половине 2018 года.
После начальной настройки и интенсивного тестирования облако в JLU Гисен было переведено в рабочий режим в июне 2017 года. Оно уже успешно использовалось для проведения практических занятий во время первой летней школы de.NBI по облачным вычислениям для биоинформатики.
На этом мероприятии 24 участника применяли технологии облачных вычислений для анализа своих собственных биологических данных. Они научились внедрять масштабируемые решения по биоинформатике в облачной среде. С момента своего создания облако регулярно используется различными партнёрами и пользователями сети de.NBI для анализа данных.
Вычислительные ресурсы для запуска виртуальных машин дополняются выбором различных решений для хранения данных, включая SSD-диски для временного хранения, тома данных и объектное хранилище, которые могут использоваться для хранения сырых и промежуточных данных, а также окончательных результатов конвейеров анализа биоинформатики.